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2025-10-27
然而,确定所有突变基因的功能及其导致的健康结果一直是个巨大的挑战。早先的研究绘制了这些变异的顺式调控作用;但在许多情况下,这种方法并不能阐明疾病的病因。
科学家们认为,许多顺式调控基因可能并没有直接参与疾病相关过程,而是反式调控在发挥重要作用。因此,绘制跨调控连接图谱对于识别最显著的疾病基因至关重要。

众所周知,T细胞是获得性免疫系统的重要组成成分,它们的任务是抵感染和癌症。当被激活时,T细胞内数千种蛋白质的水平会发生变化,而且许多蛋白质是相互联系的。因此,一种蛋白质水平的变化会导致另一种蛋白质水平的变化。
过去的方法是使用CRISPR基因编辑工具敲除一组选定的基因,然后测量基因表达的变化,然后确定其在人类T细胞中的下游靶点。但这种所谓的“下游映射”方法只识别了转录网络中敲除基因下游的基因。因此,只揭示了部分真相。
相比之下,“上游映射”将使研究人员可以从感兴趣的基因开始,无偏地发现控制其表达的上游调节因子。上游映射可用于识别已知疾病基因的调节因子,并推断顺式调控上游基因与疾病相关的基因突变如何反式调控下游疾病基因。
现在,研究人员将这些蛋白质和基因之间的联系绘制成类似地铁地图的网络,从而可以帮助解释为什么两个不同免疫基因的突变可能导致相同的疾病,或者一种药物如何同时对许多免疫蛋白产生影响。
这种上游映射的方法就像规划地铁线路一样,首先确定主要枢纽,然后确定到这些关键站点的路线,而不是费力地从不同的卫星站重建整个网络。
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